Application of Molecular Evolution in Court : Source Identification in A Large Hepatitis C Virus Outbreak
Main Article Content
Abstract
Molecular phylogenetic analyses are used in various applications, such as studying the diversity of organisms, co–evolution, investigation of molecular epidemiology, etc. This review presents principle of molecular phylogenetic analysis by comparison of nucleotide sequences, hepatitis C virus, source identification in a large hepatitis C virus outbreak at Valencia, Spain, and consideration in application of molecular evolution in court for investigation of pathogen source that would lead to liability compensation.
Article Details
How to Cite
Khamsri, Boonruang. “Application of Molecular Evolution in Court : Source Identification in A Large Hepatitis C Virus Outbreak”. Naresuan University Law Journal 6, no. 2 (March 27, 2014): 97–111. Accessed September 1, 2024. https://so04.tci-thaijo.org/index.php/lawnujournal/article/view/98757.
Section
Academic Articles
References
เจษฎา เด่นดวงบริพันธ์. วิวัฒนาการ (Evolution). กรุงเทพฯ: สำนักพิมพ์แห่งจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, 2555.
ชโลบล อยู่สุข. “ไวรัสก่อโรคตับอักเสบ.” ใน ไวรัสวิทยา. บรรณาธิการโดย พิไลพันธ์ พุธวัฒนะ, ชโลบล อยู่สุข, บุญยศ เรืองสกุลราช, วรรณี กัณฐกมาลากุล, 13-23, พิมพ์ครั้งที่ 2. กรุงเทพฯ: อักษรสมัย, 2540.
อัจฉริยา รังษิรุจิ. วิวัฒนาการ: จากทฤษฎีสู่การประยุกต์. กรุงเทพฯ: เท็กซ์ แอนด์ เจอร์นัล พับลิเคชั่น, 2555.
แผนกคดีผู้บริโภค ศาลฎีกา. "ประวัติแผนก." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2549. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.
supremecourt.or.th/webportal/maincode/content.php?content=component/content/view.php&id=2&base=17&base=17.
สำนักงานคณะกรรมการสุขภาพแห่งชาติ. "ข้อมูลประกอบการพิจารณาร่างพระราชบัญญัติคุ้มครองผู้เสียหายจากการรับบริการสาธารณสุข." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.nationalhealth.or.th/index.phpoption=com_content&
view=article&id=329:2010–08–16–05–03–16&catid=95:2010–02–22–23–30–10.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติ ให้ใช้บทบัญญัติบรรพ 1 แห่งประมวล
กฎหมายแพ่งและพาณิชย์ที่ได้ตรวจชำระใหม่ พ.ศ. 2535." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538976485&Ntype=21.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติหลักประกันสุขภาพแห่งชาติ พ.ศ. 2545." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5
ตุลาคม 2556, จากhttps://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538976332&Ntype=19.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติวิธีพิจารณาคดีผู้บริโภค พ.ศ. 2551." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม
2556. https://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538975434&Ntype=19.
Choo, Q.L., Kuo, G., Weiner, A.J., Overby, L.R., Bradley, D.W. and Houghton, M. “Isolation of a cDNA clone derived from a blood–borne non–A, non–B viral hepatitis genome.” Science. 244, no.4902 (1989): 359–362.
Dos Reis, M., Inoue, J., Hasegawa, M., Asher, R.J., Donoghue, P.C.J. and Yang, Z. “Phylogenomic datasets provide both precision and accuracy in estimating the timescale of placental mammal phylogeny.” Proc R Soc B. 279, no.1742 (2012): 3491–3500.
Drummond, A.J. and Rambaut, A. “BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees.” BMC Evol Biol. 7, (2007): 214.
Esteban, J.I., Gómez, J., Martell, M., Cabot, B., Quer, J., Camps, J., et al. “Transmission of hepatitis C virus by a cardiac surgeon.” N Engl J Med. 334, no.9 (1996): 555–560.
Esteban, J.I., Sauleda, S. and Quer, J. “The changing epidemiology of hepatitis C virus infection in Europe.” J Hepatol. 48, (2008): 148–162.
Feinstone, S.M., Kapikian, A.Z., Purcell, R.H., Alter, H.J. and Holland, P.V. “Transfusion–associated hepatitis not due to viral hepatitis type A or B.” N Engl J Med. 292, no.15 (1975): 767–70.
Felsenstein, J. “Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap.” Evolution. 39, no.4 (1985): 783–791.
González–Candelas, F., Bracho, M.A., Wróbel, B. and Moya, A. “Molecular evolution in court: analysis of a large hepatitis C virus outbreak from an evolving source.” BMC Biol. 11, (2013): 76.
Hajarizadeh, B., Grebely, J. and Dore, G.J. “Epidemiology and natural history of HCV infection.” Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 10, no.9 (2013): 553–562.
Penin, F., Dubuisson, J., Rey, F.A., Moradpour, D. and Pawlotsky, J.M. (2004). “Structural biology of hepatitis C virus.” Hepatology. 39, no.1 (2004): 5–19.
Pradat, P. and Trepo, C.“HCV: Epidemiology, Modes of Transmission and Prevention of Spread.” Baillieres Best Pract Res Clin Gastroenterol. 14, no.2 (2000): 201–210.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S. “MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods.” Mol Biol Evol. 28, no.10 (2011): 2731–2739.
Felsenstein, J. "PHYLIP: Phylogeny Inference Package Version 3.695." Last modified April, 2013. Accessed September 9, 2013. https://evolution.genetics.washington.edu/phylip/doc/main.html.
ชโลบล อยู่สุข. “ไวรัสก่อโรคตับอักเสบ.” ใน ไวรัสวิทยา. บรรณาธิการโดย พิไลพันธ์ พุธวัฒนะ, ชโลบล อยู่สุข, บุญยศ เรืองสกุลราช, วรรณี กัณฐกมาลากุล, 13-23, พิมพ์ครั้งที่ 2. กรุงเทพฯ: อักษรสมัย, 2540.
อัจฉริยา รังษิรุจิ. วิวัฒนาการ: จากทฤษฎีสู่การประยุกต์. กรุงเทพฯ: เท็กซ์ แอนด์ เจอร์นัล พับลิเคชั่น, 2555.
แผนกคดีผู้บริโภค ศาลฎีกา. "ประวัติแผนก." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2549. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.
supremecourt.or.th/webportal/maincode/content.php?content=component/content/view.php&id=2&base=17&base=17.
สำนักงานคณะกรรมการสุขภาพแห่งชาติ. "ข้อมูลประกอบการพิจารณาร่างพระราชบัญญัติคุ้มครองผู้เสียหายจากการรับบริการสาธารณสุข." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.nationalhealth.or.th/index.phpoption=com_content&
view=article&id=329:2010–08–16–05–03–16&catid=95:2010–02–22–23–30–10.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติ ให้ใช้บทบัญญัติบรรพ 1 แห่งประมวล
กฎหมายแพ่งและพาณิชย์ที่ได้ตรวจชำระใหม่ พ.ศ. 2535." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม 2556. https://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538976485&Ntype=21.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติหลักประกันสุขภาพแห่งชาติ พ.ศ. 2545." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5
ตุลาคม 2556, จากhttps://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538976332&Ntype=19.
ศูนย์ทนายความทั่วไทย. "พระราชบัญญัติวิธีพิจารณาคดีผู้บริโภค พ.ศ. 2551." แก้ไขล่าสุดเมื่อ 2553. สืบค้นเมื่อ 5 ตุลาคม
2556. https://www.thailandlawyercenter.com/index.php?lay=show&ac=article&Id=538975434&Ntype=19.
Choo, Q.L., Kuo, G., Weiner, A.J., Overby, L.R., Bradley, D.W. and Houghton, M. “Isolation of a cDNA clone derived from a blood–borne non–A, non–B viral hepatitis genome.” Science. 244, no.4902 (1989): 359–362.
Dos Reis, M., Inoue, J., Hasegawa, M., Asher, R.J., Donoghue, P.C.J. and Yang, Z. “Phylogenomic datasets provide both precision and accuracy in estimating the timescale of placental mammal phylogeny.” Proc R Soc B. 279, no.1742 (2012): 3491–3500.
Drummond, A.J. and Rambaut, A. “BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees.” BMC Evol Biol. 7, (2007): 214.
Esteban, J.I., Gómez, J., Martell, M., Cabot, B., Quer, J., Camps, J., et al. “Transmission of hepatitis C virus by a cardiac surgeon.” N Engl J Med. 334, no.9 (1996): 555–560.
Esteban, J.I., Sauleda, S. and Quer, J. “The changing epidemiology of hepatitis C virus infection in Europe.” J Hepatol. 48, (2008): 148–162.
Feinstone, S.M., Kapikian, A.Z., Purcell, R.H., Alter, H.J. and Holland, P.V. “Transfusion–associated hepatitis not due to viral hepatitis type A or B.” N Engl J Med. 292, no.15 (1975): 767–70.
Felsenstein, J. “Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap.” Evolution. 39, no.4 (1985): 783–791.
González–Candelas, F., Bracho, M.A., Wróbel, B. and Moya, A. “Molecular evolution in court: analysis of a large hepatitis C virus outbreak from an evolving source.” BMC Biol. 11, (2013): 76.
Hajarizadeh, B., Grebely, J. and Dore, G.J. “Epidemiology and natural history of HCV infection.” Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 10, no.9 (2013): 553–562.
Penin, F., Dubuisson, J., Rey, F.A., Moradpour, D. and Pawlotsky, J.M. (2004). “Structural biology of hepatitis C virus.” Hepatology. 39, no.1 (2004): 5–19.
Pradat, P. and Trepo, C.“HCV: Epidemiology, Modes of Transmission and Prevention of Spread.” Baillieres Best Pract Res Clin Gastroenterol. 14, no.2 (2000): 201–210.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S. “MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods.” Mol Biol Evol. 28, no.10 (2011): 2731–2739.
Felsenstein, J. "PHYLIP: Phylogeny Inference Package Version 3.695." Last modified April, 2013. Accessed September 9, 2013. https://evolution.genetics.washington.edu/phylip/doc/main.html.